Lejos en el espacio, en la órbita de uno de los planetas, había una nave espacial en la que había un laboratorio en el que se realizaban experimentos con varios animales. Fueron inyectados con ADN alienígena y observaron cómo cambiaban. Al igual que con la base, la conexión desapareció y los soldados fueron enviados allí desde el Asalto Estelar. Seremos uno de ellos en el juego Attack on the Mothership. Nuestro personaje está armado con una munición estándar. Su tarea es penetrar la nave y descubrir lo que sucedió allí. Resultó que toda la tripulación se convirtió en monstruos y ahora tienes que entrar en batalla con ellos. Usando tus armas, debes destruir rápida y efectivamente a todos los monstruos que encontrarás en la cubierta de la nave.